Palestrantes

Laurent E. Dardenne

LNCC/MCTI

Laurent E. Dardenne - Biografia

Possui graduação em Física pela Universidade de Brasília (1992), mestrado em Física pela Universidade de Brasília (1995) e doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica) pelo Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho da Universidade Federal do Rio de Janeiro (2000). Atualmente é pesquisador do Laboratório Nacional de Computação Científica e líder do Grupo de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos (GMMSB/LNCC). Tem experiência na área de Biofísica, com ênfase em Modelagem Molecular. Desde 2001, ele tem se dedicado a desenvolver métodos inovadores, algoritmos e programas em Modelagem Molecular, com ênfase específica em planejamento de fármacos e previsão da estrutura de proteínas. Concebeu e liderou o desenvolvimento do servidor DockThor-VS (www.dockthor.lncc.br). Sua pesquisa atual se concentra em criar novas metodologias para Acoplamento Molecular, Triagem Virtual e Planejamento de Fármacos de novo, utilizando Aprendizado de Máquina e Técnicas Evolutivas.

Roberto Lins

Fiocruz/MS

CV Lattes

Roberto Lins - Biografia

Roberto D. Lins é bacharel em Ciências Biológicas e doutor em química pela UFPE (Brasil). Durante seu doutorado, trabalhou sob a orientação dos professores Ricardo Ferreira (UFPE, Brasil) e J. Andrew McCammon (UCSD, EUA). Foi visiting assistant professor na University of Houston (EUA) e pós-doutor no ETH-Zurique e EPF-Lausanne (ambos na Suíça). Em 2005 assumiu o cargo de Senior Research Scientist no Pacific Northwest National Laboratory (EUA), e em 2009 tornou-se Professor de Química na UFPE (Brasil). Em 2014 tornou-se Pesquisador em Saúde Pública na Fundação Oswaldo Cruz (Brasil), onde coordena um laboratório computacional-experimental com foco na engenharia de novas vacinas à base de proteínas, produtos biofarmacêuticos e marcadores de diagnóstico para doenças infecciosas virais.

Hugo Verli

UFRGS

CV Lattes

Hugo Verli - Biografia

Possui graduação em Farmácia (UFRJ, 2001), mestrado em Química (UFRJ, 2002) e doutorado em Biologia Celular e Molecular (UFRGS, 2005). É professor da UFRGS desde 2006 e titular desde 2022. Foi membro afiliado da ABC (2012-2016), orientou cerca de 40 pós-graduandos e possui mais de 100 publicações, com aproximadamente 2.500 citações, alcançando um índice H de 29 (WoS) e 37 (Google Acadêmico). Coordenou o PPGBCM da UFRGS, conceito 7 na CAPES, entre 2020 e 2023. Atualmente, é vice-diretor do Centro de Biotecnologia da UFRGS. Atua em Bioinformática Estrutural e Simulação Molecular, com foco em dinâmica de biomoléculas, parametrização de compostos bioativos, e estrutura e dinâmica de carboidratos e glicoconjugados. É membro do INCT BioOncoPed.

Leandro Martínez

Unicamp

CV Lattes

Leandro Martínez - Biografia

Bacharel em Química, Mestre em Ciências e Doutor em Físico-Química pela Universidade Estadual de Campinas. Fez pós-doutorado na Unidade de Bioinformática Estrutural do Instituto Pasteur em Paris, e na Unicamp. Tem experiência em Química Teórica e Computacional. Estuda biofísica de proteínas, em particular a estabilidade conformacional de macromoléculas em meios não-convencionais. É o desenvolvedor principal do pacote Packmol. Foi docente no Instituto de Física de São Carlos da Universidade de São Paulo de 2010 a 2012 e atualmente é livre docente no Instituto de Química da Unicamp.

Matheus M. P. da Silva

LNCC/MCTI

CV Lattes

Matheus M. P. da Silva - Biografia

Doutorando em Modelagem Computacional pelo Laboratório Nacional de Computação Científica (LNCC) e mestre em Modelagem Computacional, também pelo LNCC (conceito 7 pela CAPES). Bacharel em Ciências Biológicas: Biotecnologia pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ). Possui experiências nas áreas de biologia e computação, com ênfase em biologia computacional, inteligência artificial, aprendizado de máquina e algoritmos evolucionistas aplicados às áreas da biologia e planejamento de fármacos. Bolsista de Doutorado Nota 10 pela Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ).

Fábio L. Custódio

LNCC/MCTI

CV Lattes

Fábio L. Custódio - Biografia

Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (2000) e doutorado em Modelagem Computacional - Laboratório Nacional de Computação Científica (2008). Atualmente é tecnologista no Laboratório Nacional de Computação Científica. Tem experiência na área de Ciência da Computação, com ênfase em Biologia Computacional, atuando principalmente nos seguintes temas: predição de estrutura de proteínas, algoritmos genéticos e modelagem molecular.

Kaline R. Coutinho

USP

CV Lattes

Kaline R. Coutinho - Biografia

Graduação e Mestrado em Física (UFPE, 1985-1991); Doutorado em Física (USP, 1993-1997); docente/pesquisadora na Univ. de Mogi das Cruzes (1997-2004) e no IF/USP (2004-atual); Livre-docente (2012) e Titular (2019) no IF/USP. Diretora do IF/USP (2023-atual, 1ª mulher); Coordenadora da Física e Astronomia da CAPES (2024-atual); Coordenadora Adjunta da CAPES (2022-2024); Membro da ACIESP (2023-atual); Membro do Comitê de Assessoramento do CNPq (2020-2023); Chefe do Departamento de Física Geral do IF/USP (2018-2022); Coordenadora do Centro de Computação do IF/USP (2020-2023). Experiência em Física e Modelagem Molecular, com ênfase em Simulação Computacional. Atua em matéria mole, solventes, propriedades eletrônicas/estruturais, interfaces, misturas líquidas, materiais porosos, agregados moleculares e nanotecnologia. Desenvolve códigos computacionais com alunos. Em Mar/2024: ~140 artigos, 3500 citações, H=33. Bolsista de Produtividade 1B.

Marcelo S. Castilho

UFBA

CV Lattes

Marcelo S. Castilho - Biografia

Marcelo Santos Castilho é graduado em Farmácia pela Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho (1997), possui mestrado pelo Instituto de Química da Universidade de São Paulo – Campus Ribeirão Preto (2000) e doutorado em Física pela Universidade de São Paulo, Campus São Carlos. Ocupou vários cargos na divisão de Química Medicinal e Química Biológica da Sociedade Brasileira de Química e recebeu o prêmio de pesquisador vanguarda na 10ª edição do BrazMedChem (2022). Atualmente, é professor titular de Química Medicinal na Universidade Federal da Bahia, com ampla experiência em identificação e otimização de compostos bioativos por meio de ferramentas computacionais, ensaios in vitro e celulares.

Claudio N. Cavasotto

Universidad Austral

CV Lattes

Claudio N. Cavasotto - Biografia

Claudio Cavasotto received his BA/MSc and PhD degrees in Physics from the University of Buenos Aires (Argentina) in the field of computational chemical-physics. He moved into the field of biomolecular simulation for his postdoctoral training at The Scripps Research Institute (La Jolla, CA), after which in 2002 he joined Molsoft LLC (San Diego, CA) as a senior research scientist until 2007. He then took up a position in the School of Biomedical Informatics (University of Texas Health Science Center at Houston), where he remained until 2011 as an associate professor. Since 2012 he is head of the Computational Drug Design and Biomedical Informatics lab (Universidad Austral-CONICET, Argentina). His research interests are in the field of biomolecular simulation, computer-aided drug design, and cheminformatics. His group develops and applies computational methods to design modulators of biomolecular targets with high therapeutic relevance, with a special focus on anti-viral agents.

Rafaela Salgado

UFMG

CV Lattes

Rafaela Salgado - Biografia

É farmacêutica pela UFMG e doutora em Química e Química Biológica pela University of California San Francisco, EUA. Fez pós-doutorado na Universidade de São Paulo em 2010 e foi pesquisadora visitante no Centre de Biochimie Structurale em Montpellier, França, em 2018. Desde 2011, é afiliada ao Departamento de Bioquímica e Imunologia da UFMG e coordenadora do Laboratório de Modelagem Molecular e Planejamento de Fármacos, onde utiliza técnicas computacionais e experimentais para desenvolver novos ligantes para alvos terapêuticos. Atua no desenvolvimento racional de fármacos, com expertise em triagem virtual de bases de dados, docking molecular, modelagem comparativa e biologia estrutural. Atualmente, é chefe do Departamento de Bioquímica e Imunologia do ICB/UFMG e tesoureira da Divisão de Química Medicinal da Sociedade Brasileira de Química (gestão 2024-2026). É membro afiliada do Center for Discovery and Innovation in Parasitic Diseases (CDIPD) da University of California San Diego, EUA.

Isabella A. Guedes

LNCC/MCTI

CV Lattes

Isabella A. Guedes - Biografia

Possui graduação em Farmácia pela UNIG (2009), mestrado em Modelagem Computacional com ênfase em Biologia Computacional pelo Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC (2011) e doutorado em Modelagem Computacional pelo LNCC (2016) com período sanduíche pela Université Paris VII Denis Diderot (França). Tem experiência na área de Modelagem Molecular, com ênfase em Química Medicinal, atuando principalmente nos seguintes temas: Docking Molecular, Triagem Virtual, Aprendizagem de Máquina e Desenvolvimento de Funções de Avaliação. Atualmente pesquisadora no Laboratório Nacional de Computação Científica (LNCC), unidade de pesquisa do Ministério de Ciência, Tecnologia e Inovações (MCTI), pelo edital Jovem Pesquisador Fluminense (Faperj).

Gerd Bruno

UFPB

CV Lattes

Gerd Bruno - Biografia

Professor Titular da Universidade Federal da Paraíba (UFPB). Concluiu o doutorado em Química pela Universidade Federal de Pernambuco (UFPE) em 2002. Gerd Rocha publicou 85 artigos científicos e possui experiência em Química Teórica, atuando nos seguintes assuntos: desenvolvimento de métodos de química quântica semiempíricos; complexos de lantanídeos; Programação em GPU; computação de alto desempenho; métodos de escalonamento linear; simulações moleculares de sistemas biológicos e químicos; e cálculo de estrutura eletrônica de biomoléculas e processos biomoleculares. Orientou onze dissertações de mestrado e sete teses de doutorado. Co-orientou 8 dissertações de mestrado e duas teses de doutorado, além de ter orientado mais de 40 trabalhos de iniciação científica nas áreas de Química e Física. Recebeu 17 prêmios e/ou homenagens. Informações adicionais sobre suas atividades científicas e grupo de pesquisa podem ser encontradas em http://www.quantum-chem.pro.br/.

Jerônimo Lameira

UFPA

CV Lattes

Jerônimo Lameira - Biografia

Graduado em Química pela Universidade Federal do Pará (2004). Doutor em Físico-Química pela Universidade Federal do Pará (2008) com estágio de um ano na universidade de JAUME I (Espanha). Realizou Pós-doutorado (Nov/2012-Nov/2014) na University of Southern California sob a supervisão do Professor Arieh Warshel (Prêmio Nobel de Química em 2013). Atualmente é Professor Associado do Instituto de Ciências Biológicas da Universidade Federal do Pará. Desenvolve pesquisa nos seguintes temas: Simulação computacional de catálise e inibição enzimática, modelagem de proteínas, QSAR, métodos hibridos QM/MM, dinâmica molecular, Enzimas envolvidas na degradação do PET e Educação ambiental.

Priscila V. Z. C. Goliatt

UFJF

CV Lattes

Priscila V. Z. C. Goliatt - Biografia

Biomédica com mestrado, doutorado e pós-doutorado em modelagem computacional. É professora adjunta no Departamento de Ciência da Computação da UFJF, permanente na Pós-graduação em Modelagem Computacional da UFJF e colaboradora nas Pós-graduações em Química e Farmácia da UFJF. Foi vice-diretora executiva da Fundação de Apoio ao Ensino Pesquisa e Extensão de Juiz de Fora, é coordenadora do grupo de pesquisa do CNPq, o Grupo de Modelagem Computacional Aplicada (GMCA), é coordenadora do Time Enactus UFJF para o Empreendedorismo Social e coordenadora do Empreeduca. Possui experiência em predição de estrutura 3D de proteínas, em interação proteína-ligante e proteína-proteína, e em dinâmica molecular de proteínas, ligantes, carreadores, membranas e sistemas complexos.

Jorge Hernández González

UNESP

CV Lattes

Jorge Hernández González - Biografia

Possui experiência em Biofísica, com ênfase em métodos computacionais para estudo de interações moleculares, triagem molecular, dinâmica molecular, cálculos de energia livre, alosteria e planejamento de fármacos. Atualmente, faz pós-doutorado na UNESP focado na inibição das toxinas esfoliativas do Staphylococcus aureus. Trabalhou nessa linha como pós-doutorando na Univ. de Viena (2022-2023) e na UFRJ (2020-2021), estudando inibidores da protease do SARS-CoV-2. Doutorado em Biofísica Molecular pela UNESP (2020), com foco no planejamento de fármacos contra malária. Estagiou no Instituto de Modelagem Molecular e Simulação da BOKU, Áustria (2016), e na Univ. de Toronto, Canadá (2013-2014). Mestrado em Bioquímica das Proteínas e Enzimas na Univ. de Havana (2014). Iniciou sua trajetória no Centro de Imunologia Molecular, Cuba (2007-2009), e no Lab. de Inibidores de Proteases da Univ. de Havana (2009-2012). Graduação em Bioquímica pela Univ. de Havana (2009).

Ingrid B. S. Martins

UNESP

CV Lattes

Ingrid B. S. Martins - Biografia

Bacharel em Física Biológica pelo Ibilce/Unesp. Licenciada em Física pela Universidade de Uberaba, Mestre e Doutora em Biofísica Molecular pelo Ibilce/Unesp, trabalha com projetos de pesquisa relacionados à biofísica molecular computacional de macromoléculas biológicas para entender interações proteína-ligante, proteína-proteína e proteína-membrana.

João Hermínio da Silva

Fiocruz/MS

CV Lattes

João Hermínio da Silva - Biografia

Pesquisador em saúde pública da Fiocruz Ceará. Biólogo, com mestrado em biofísica pela UFRJ e doutorado em biologia celular e molecular pela Fiocruz. Realizei intercâmbio sanduiche no Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier e recentemente como pesquisador sênior no Conservatoire National des Arts et Métiers (Paris). Colaboro com pesquisadores do Institut Pasteur e USP, com fomento do CNPq, FIOCRUZ, CAPES e FUNCAP. Oriento nos programas de pós-graduação em Biologia Computacional e Sistemas (IOC) e Biotecnologia de Recursos Naturais (UFC). Atualmente coordeno o Centro Pasteur-FIOCRUZ de imunologia e imunoterapia, localizado na FIOCRUZ Ceará.

Pedro H. M. Torres

UFRJ

CV Lattes

Pedro H. M. Torres - Biografia

Possui graduação em Ciências Biológicas: Microbiologia e Imunologia (2005-2008), Mestrado em Biofísica (2009) e Doutorado em Biofísica (2014) pela Universidade Federal do Rio de Janeiro. Tem experiência na área de Microbiologia, Bioquímica e Biofísica, atuando principalmente nas área de biologia estrutural computacional, desenho de fármacos assistido por computador e bioinformática. Foi professor substituto na Universidade do Estado do Rio de Janeiro e professor convidado na Universidade Federal do Rio de Janeiro e na Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz). Também na Fiocruz, trabalhou como pesquisador do Programa de Computação Científica (2016-2018). Atuou como pesquisador associado no Departamento de Bioquímica da Universidade de Cambridge (2018-2020). É professor do Instituto de Bíofísica Carlos Chagas Filho (UFRJ) desde março de 2020 e integrante do Conselho Fiscal do Espaço Ciência Viva (ECV) desde maio de 2021.

Pedro G. Pascutti

UFRJ

CV Lattes

Pedro G. Pascutti - Biografia

Possui graduação em Física pela Universidade Estadual de Londrina (1986), mestrado (1990) e doutorado (1996) em Física pela Universidade de São Paulo, pós-doutorado em Biofísica Molecular na Universidade Federal do Rio de Janeiro - UFRJ (1998) e no Instituto Beckman na Universidade de Illinois, Estados Unidos (2018). É professor Associado IV no Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho da UFRJ. Tem experiência em Biofísica Molecular teórica e experimental e desenvolve pesquisas em modelagem computacional e dinâmica molecular em complexos proteicos, biomembranas e planejamento de fármacos. Chefia o Laboratório de Modelagem e Dinâmica Molecular do IBCCF, UFRJ, foi Cientista do Nosso Estado FAPERJ (2009-2011), coordenou a Área Interdisciplinar da CAPES(adjunto: 2007-2010, titular: 2010-2014) e foi membro titular do Conselho Técnico e Científico do Ensino Superior do Brasil (2010-2013).

Mauricio G. S. Costa

Fiocruz/MS

CV Lattes

Mauricio G. S. Costa - Biografia

Possui graduação em Ciências Biológicas - Modalidade Médica pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (2007), mestrado em Ciências Biológicas - Biofísica pelo Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho (2009) e doutorado na mesma área (2014) obtido em regime de co-tutela com a École Normale Supérieure de Cachan (França). Desde 2013 é pesquisador em saúde pública na Fundação Oswaldo Cruz, onde atua como membro permanente da Pós Graduação em Biologia Computacional e Sistemas. Tem experiência na área de biofísica molecular e estrutural com ênfase em simulações computacionais e no processamento de imagens de Crio-eletro Microscopia.

Igor Barden Grillo

UFPB

CV Lattes

Igor Barden Grillo - Biografia

Químico computacional desde o fim da formação de graduação em química na PUCRS, conheci o meu orientador da pós-graduação em um evento do LNCC em 2016 e fui fazer o meu mestrado e doutorado na UFPB. Hoje em dia sou pós-doutorando no mesmo laboratório de química quântica e computacional da UFPB. Hoje em dia trabalho com o desenvolvimento de softwares de simulação, modelagem e cálculos de descritores quânticos focados para aplicação em grandes moléculas relevantes a processos biológicos.

Ernesto R. Caffarena

Fiocruz/MS

CV Lattes

Ernesto R. Caffarena - Biografia

Graduado em Física (1993) e doutor em Ciências Exatas (1996) pela Universidade Nacional de La Plata, Argentina e atualmente é pesquisador titular da Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ). Atuou como Coordenador do programa de Pós-graduação em Biologia Computacional e Sistemas do IOC-FIOCRUZ entre os anos 2013-2017 e como Coordenador Adjunto no período 2018-2021. Atualmente, coordena o Programa de Computação Científica da FIOCRUZ. É membro da Sociedade Brasileira de Biofísica (SBBf) e editor dos periódicos "Memórias do Instituto Oswaldo Cruz" e "Frontiers in Drug Discovery". Possui experiência na área de Biofísica Molecular, com ênfase em Dinâmica Molecular e Cálculos Computacionais de energia livre, sendo líder do Grupo de Pesquisa em Biofísica Computacional e Modelagem Molecular do CNPq. É bolsista de produtividade 1D do CNPq e Cientista do Nosso Estado da FAPERJ.

Danilo F. Coêlho

UFPE

CV Lattes

Danilo F. Coêlho - Biografia

Atua na área de Química Teórica e Simulação de Sistemas Biológicos, com ênfase no desenvolvimento de novas biomoléculas por meio de Engenharia de Proteínas, bem como Modelagem e Caracterização Estrutural de Biomoléculas, usando métodos de Mecânica Molecular. Possui experiência em metodologias experimentais em Biologia Molecular, como expressão e caracterização de proteínas, análises biofísicas, e estudo de diagnóstico e resposta humoral.

Manuela Leal

UFRJ

CV Lattes

Manuela Leal - Biografia

Possui graduação em Química Industrial (UFSM, 2004), Mestrado em Química Medicinal (IME, 2007) e Doutorado em Ciências (Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho, UFRJ, 2011). Realizou pós-doutorados na École Normale Supérièure de Cachan (LBPA, França), Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho (UFRJ) e Inmetro. Atualmente, é Professora Adjunta no NUPEM/UFRJ e docente dos programas de Pós-Graduação em Biologia Computacional e Sistemas (IOC/Fiocruz), Ciências Fisiológicas (UFRJ) e Biotecnologia (Inmetro). Coordena os projetos de extensão "A importância das macromoléculas na saúde humana" e "Projeto de Inclusão Digital do NUPEM". Tem experiência em Biologia e Química Computacional, Biofísica Molecular, Farmacologia, Genômica Estrutural, Bioinformática, Modelagem Molecular, Bioquímica, Química Medicinal e Biotecnologia Farmacêutica.

Camila S. de Magalhães

UFRJ

CV Lattes

Camila S. de Magalhães - Biografia

Possui doutorado em Modelagem Computacional pelo Laboratório Nacional de Computação Científica (2006). Atualmente é Professora Associada do Campus Duque de Caxias da Universidade Federal do Rio de Janeiro - UFRJ. Tem experiência na área de Ciência da Computação, com ênfase em Inteligência Artificial, atuando principalmente nos seguintes temas: algoritmos genéticos, modelagem molecular, aprendizado de máquina e reconhecimento de padrões.

Leon S. C. Costa

LNCC/MCTI

CV Lattes

Leon S. C. Costa - Biografia

Atualmente pesquisa inteligencia artificial focado em Large Language Models aplicados a dados químicos. É doutorando em Modelagem Computacional pelo Laboratório Nacional de Computação Científica(LNCC/MCTI) e mestre em Modelagem Computacional pela mesma instituição. Bacharel em Biossistemas pela Universidade Federal de São João del-Rei. Possui experiência em pesquisa nas áreas de modelagem molecular, bioinformática e inteligencia artificial aplicada a química computacional.

Ana L. Karl

LNCC/MCTI

CV Lattes

Ana L. Karl - Biografia

Bacharel em Biomedicina pela Universidade Católica de Petrópolis (UCP, 2016) e Tecnologista em Tecnologia da Informação e Comunicação pela FAETERJ Petrópolis (2023). Mestre (2019) e Doutoranda em Modelagem Computacional pelo Laboratório Nacional de Computação Científica (LNCC/MCTI). Possui experiência interdisciplinar nas áreas de Biologia e Computação, com foco no desenvolvimento de metodologias de flexibilização do receptor em experimentos de docking e sua aplicação em diversos alvos biológicos, incluindo acetilcolinesterase, T4 lisozima, aldose redutase, HIV-1 protease e alvos moleculares do SARS-CoV-2.

Letícia C. de Assis

LNCC/MCTI

CV Lattes

Letícia C. de Assis - Biografia

Possui graduação em Química (2012), doutora em Ciências, área de concentração Química/Bioquimica, todos da Universidade Federal de Lavras ( 2018) . Em 2018, realizou um estágio na Universidade Federal de São João del Rei, na área de Biotecnologia. Em 2020, realizou um estágio na Embrapa. Atualmente é estagiária de pós- doutorado no laboratório Nacional de Computação Científica, área modelagem molecular. Tem experiência na área de Química Teória e Medicinal, atuando nos seguintes temas: Triagem virtual, ancoramento molecular e dinâmica molecular.

Elton Chaves

FURG

CV Lattes

Elton Chaves - Biografia

Biólogo e doutor em Biotecnologia. Atualmente é pesquisador na FURG e UFPB, onde exerce atividades de pesquisa no grupo coordenado pelo Prof. Dr. Luís Fernando Marins e Prof. Dr. Gerd Bruno Rocha. Além disso, também atua como colaborador no grupo de pesquisa de Engenharia de Proteínas e Genômica Estrutural da FIOCRUZ/PE, coordenado pelo Dr. Roberto Lins. Possui experiência com modelagem/simulação molecular de sistemas biológicos, cálculos teóricos de energia livre e biologia molecular. Suas principais contribuições e interesses em pesquisa científica concentram-se nas áreas de bioquímica computacional, planejamento racional de fármacos e engenharia de proteínas.